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中科院微生物研究所微生物資源中心的詳細介紹
中國科學院微生物研究所微生物資源中心(IMCAS-BRC)是在中國普通微生物菌種保藏管理中心(CGMCC)和微生物所信息中心的微生物資源信息數據庫與共享平臺基礎上,通過設立微生物功能評價部門,并完善質量保證系統而組建的公益性機構。它在CGMCC的微生物物種保藏基礎上,重點加強了微生物資源深度開發利用的研究以及資源質量保證及其共享的標準體系。
IMCAS-BRC以科學家為主導,以技術人員為主體,依托微生物資源前期開發國家重點實驗室和中國科學院真菌地衣系統學重點實驗室的研究優勢,將注重認識并開發利用微生物資源的功能;同時,以“整合資源、認識功能、開放共享、服務社會”為建設原則,IMCAS-BRC將對科研、教學及產業部門提供資源和技術服務,并與國內外科研機構、產業實體開展合作研發。
基于完善的信息數據系統,IMCAS-BRC與國際上多個微生物資源中心(BRC)合作共享資源信息,共建地區、乃至全球的BRC網絡;同時按照經濟合作與發展組織(OECD)的BRC標準,進一步完善資源管理體系和質量保證系統。
微生物資源前期開發國家重點實驗室主任東秀珠研究員擔任IMCAS-BRC主任。IMCAS-BRC下設4個部門:保藏部、功能評價部、信息部和質量保證辦公室。保藏部主任為中國普通微生物菌種保藏管理中心主任周宇光;功能評價部主任為中國科學院真菌地衣系統學重點實驗室研究員車永勝;信息部主任為微生物研究所信息中心主任馬俊才;質量保證辦公室主任為微生物研究所工業微生物與生物技術研究室研究員張立新。
1.微生物資源中心保藏部
微生物資源中心保藏部(以下簡稱保藏部)以中國普通微生物菌種保藏管理中心(CGMCC)為基礎組建,宗旨是廣泛收集保藏各類微生物菌株、細胞株和基因,為微生物資源的保護、共享和持續利用提供服務和支持。
CGMCC成立于1979年,是提供專業技術服務的公益性機構。作為國家知識產權局指定的專利微生物保藏中心,1995年被世界知識產權組織批準具有布達佩斯條約國際保藏單位資質。保藏部建有菌種庫、細胞庫和基因庫。目前保藏各類微生物菌種4000余種、35000余株(其中用于專利程序的培養物3200余株),并建有熱泉和牦牛瘤胃微生物群落元基因組BAC文庫和質粒文庫(庫容量達76000個克隆、DNA插入片段達418 Mbp)。
保藏部設有高通量培養技術組、環境基因資源技術組、細胞培養技術組及快速準確鑒定技術組。技術人員目前正在建立一系列技術平臺,包括難培養和特殊環境微生物的高通量培養和保藏技術平臺,環境基因組文庫建立和保藏技術平臺,及準確快速物種鑒定技術平臺等。這些技術平臺的建設目標是獲得特殊類群和特殊功能的微生物培養物及其功能基因,為微生物功能的利用貯備具有自主知識產權的資源。
保藏部對科研、教學和政府部門提供各類微生物菌種和細胞株,保存用于專利程序的各種可培養生物材料,鑒定微生物菌種,并提供與微生物資源相關的技術咨詢和情報服務。CGMCC還與國內外微生物保藏及研究機構保持著密切聯系。
2.微生物資源中心功能評價部
微生物資源中心功能評價部(以下簡稱功能評價部)以中國普通微生物菌種保藏管理中心(CGMCC)、微生物資源前期開發國家重點實驗室、中國科學院真菌地衣系統學重點實驗室的研究力量與菌種資源為依托,建立微生物功能活性物質的高通量篩選技術體系和評價系統;利用該技術體系發現與人類生活和健康密切相關的微生物代謝產物,最終形成一個開放共享的生理活性及功能物質的發現與評價技術平臺。
功能評價部主要開展小分子化合物和蛋白質(酶)的篩選與評價。以重要疾病包括傳染病、腫瘤等為靶標,建立小分子化合物高通量篩選模型及方法;以工業發展和人類生活的需求為出發點,建立高通量酶活篩選模型與方法,包括糖苷酶、蛋白酶、脂肪酶及其它重要工業用酶等。目的是促進微生物資源的可持續利用。
功能評價部還將建立蛋白質高效表達技術平臺,包括數種原核和真核生物表達系統,尤其是可同時表達數個基因的絲狀真菌/放線菌表達系統, 用于元基因組文庫中功能基因的表達。
功能評價部建有微生物次生代謝產物(粗提物)、部分純化(餾分)以及純化合物的樣品庫,同時建立了部分篩選模型與評價方法。本部將不斷擴充樣品庫的庫容量,建立和引進多個篩選模型,拓展功能篩選和評價,并對外開放,積極開展與研究及產業部門的合作。
3. 微生物資源中心信息部
微生物資源中心信息部(以下簡稱信息部)設立于微生物研究所的信息中心,致力于建設微生物資源信息管理平臺、建立數據標準與數據規范、開發微生物資源數據庫和建設對外信息共享門戶。
信息部作為中國科學院典型培養物委員會信息中心、亞洲微生物資源保藏與可持續利用協會中國節點、國際生物鏡像網中國國家節點、Global BRC Network成員單位,長期以來致力于我國微生物資源的信息化,目前已經建立了微生物菌種信息數據庫、物種生理生化性狀數據庫、核酸序列數據庫、菌種銷售數據庫、客戶管理數據庫、中國科學院典型培養物數據庫、亞洲微生物資源目錄數據庫,并建立了我國微生物學領域最大的信息共享網,可共享數據資源超過1TB。信息部開發的微生物資源管理系統,已被我國多家微生物資源保藏中心使用,并作為亞洲微生物資源網的信息門戶平臺。
目前,信息部會同保藏部和質量保證辦公室,在維護和更新現有各數據庫系統的基礎上,正在建立高通量篩選數據庫、指紋圖譜/分子標識數據庫、微生物條形碼庫、微生物志數據庫和生物信息數據庫。此外,信息部正在開發微生物資源專用檢索引擎和生物信息學超級計算平臺。
4. 微生物資源中心質量保證辦公室
微生物資源中心質量保證辦公室負責中心的微生物資源和技術服務質量管理、知識產權管理和生物安全管理,以及中心的宣傳等工作。目標是通過規范化管理,達到保證技術服務質量、保護知識產權、杜絕安全事故的目的。
質量保證辦公室的職責包括如下三方面:
1.中心的資源及技術服務的質量保證工作:制定并組織建設中心的質量管理體系,編制管理文件,組織內部審核等;組織實施實驗室認可、計量認證工作,聯絡評審機構;組織實施質量體系培訓計劃和能力驗證等質量控制工作;協助工作委員會評估中心各部門的年度質量報告。
2.知識產權管理工作:制訂中心微生物資源相關的知識產權工作規劃和計劃;執行國家知識產權局和世界知識產權組織下達的工作;組織中心科研人員的知識產權法律、法規培訓;協助研究所知識產權主管行政部門審查、簽訂中心與國內外研究、開發機構的知識產權合作協議和技術合作協議。
3.生物安全管理工作:制定實驗室生物安全技術方案和實驗室生物安全事故應急預案;組織中心科研人員開展實驗室生物安全事件應急知識和處理技術的培訓;評估、確定保藏部受理保藏微生物菌種的生物危害等級;協助研究所生物安全主管行政部門組織實驗室生物安全檢查,監督實驗廢棄物處理;發生實驗室安全事件時,負責向研究所主管部門報告,啟動應急預案,及時組織現場處置。
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